运行时，负荷应尽可能超过柴油发电机组功率的50%以上，并尽可能使燃料在气缸内完全燃烧。使用常规渠道的柴油，焚烧后的高级燃料污染也很小。
保持柴中小型柴油发电机组燃油滤芯的过滤功能，经常检查和更换柴油滤芯，确保能有效过滤燃油中的残渣，减少废气中的污染成分。柴油发电机组将产生一氧化碳、氮氧化物、硫氧化物和其他废气。为保证柴油发电机组排放的废气不致成为公害，在排烟末端安装废气净化设备，对废气进行溶解和净化，真正减少环境污染。
柴油发电机组经废气净化设备除尘脱硫处理后，经当地相关环保部门检测，柴油发电机组排放的烟气各项指标均达到或超过排放标准。
